Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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EXT1Q16394 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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EXT1Q16394 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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EXT1Q16394 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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EXT1Q16394 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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EXT1Q16394 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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EXT1Q16394 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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EXT1Q16394 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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EXT1Q16394 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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