Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SSX1Q16384 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SSX1Q16384 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SSX1Q16384 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SSX1Q16384 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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