Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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