Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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ZNF56Q15929 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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ZNF56Q15929 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ZNF56Q15929 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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ZNF56Q15929 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
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ZNF56Q15929 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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ZNF56Q15929 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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ZNF56Q15929 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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ZNF56Q15929 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ZNF56Q15929 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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