Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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