Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SF3A1Q15459 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SF3A1Q15459 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SF3A1Q15459 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SF3A1Q15459 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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