Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms