Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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BRD3Q15059 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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BRD3Q15059 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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BRD3Q15059 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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BRD3Q15059 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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BRD3Q15059 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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BRD3Q15059 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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BRD3Q15059 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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BRD3Q15059 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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BRD3Q15059 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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BRD3Q15059 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRD3Q15059 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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