Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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