Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHD4Q14839 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHD4Q14839 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHD4Q14839 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHD4Q14839 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHD4Q14839 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHD4Q14839 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHD4Q14839 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHD4Q14839 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHD4Q14839 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHD4Q14839 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHD4Q14839 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHD4Q14839 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHD4Q14839 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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