Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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