Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPARCL1Q14515 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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