Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms