Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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