Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NAE1Q13564 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NAE1Q13564 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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NAE1Q13564 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NAE1Q13564 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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