Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XRCC4Q13426 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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