Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATMQ13315 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATMQ13315 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATMQ13315 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATMQ13315 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATMQ13315 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATMQ13315 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATMQ13315 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms