Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTK7Q13308 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms