Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX3Q13185 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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