Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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