Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
STRN3Q13033 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms