Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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