Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPN13Q12923 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms