Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNTN1Q12860 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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