Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB40BQ12829 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms