Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms