Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
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NUP160Q12769 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
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NUP160Q12769 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
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NUP160Q12769 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
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NUP160Q12769 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
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NUP160Q12769 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
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NUP160Q12769 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
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NUP160Q12769 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
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NUP160Q12769 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
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NUP160Q12769 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
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NUP160Q12769 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
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NUP160Q12769 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
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