Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230 ms