Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SYCNQ0VAF6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms