Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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FAM27E3Q08E93 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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FAM27E3Q08E93 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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FAM27E3Q08E93 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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FAM27E3Q08E93 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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FAM27E3Q08E93 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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FAM27E3Q08E93 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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FAM27E3Q08E93 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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FAM27E3Q08E93 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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