Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf54Q08AI8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms