Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms