Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms