Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FMODQ06828 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms