Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABPAQ06546 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms