Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALD1Q05682 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALD1Q05682 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms