Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIN1Q05586 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms