Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms