Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREMQ03060 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREMQ03060 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREMQ03060 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREMQ03060 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREMQ03060 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CREMQ03060 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREMQ03060 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREMQ03060 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREMQ03060 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREMQ03060 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREMQ03060 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREMQ03060 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREMQ03060 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREMQ03060 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREMQ03060 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREMQ03060 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREMQ03060 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREMQ03060 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREMQ03060 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREMQ03060 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREMQ03060 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREMQ03060 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREMQ03060 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CREMQ03060 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms