Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BNC1Q01954 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms