Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms