Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms