Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HTRA4P83105 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms