Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms