Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM11AP58511 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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