Protein–RNA interactions for Protein: P53701

HCCS, Cytochrome c-type heme lyase, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCCSP53701 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCCSP53701 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCCSP53701 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCCSP53701 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCCSP53701 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCCSP53701 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCCSP53701 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCCSP53701 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCCSP53701 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCCSP53701 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCCSP53701 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCCSP53701 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCCSP53701 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCCSP53701 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCCSP53701 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCCSP53701 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCCSP53701 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCCSP53701 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCCSP53701 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCCSP53701 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCCSP53701 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCCSP53701 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCCSP53701 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCCSP53701 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCCSP53701 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HCCSP53701 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCCSP53701 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCCSP53701 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms