Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCR4P51679 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCR4P51679 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCR4P51679 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCR4P51679 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms