Protein–RNA interactions for Protein: P49407

ARRB1, Beta-arrestin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRB1P49407 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARRB1P49407 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms