Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TGM4P49221 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms