Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LHX1P48742 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LHX1P48742 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LHX1P48742 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LHX1P48742 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms